Болничка апотека је организациони део здравствене установе на терцијарном нивоу и послује у складу са законским оквирима који уређују здравствену заштиту.

Фармацеутска здравствена делатност обухвата:

• Снабдевање Института лековима и медицинским средствима, у складу са законском регулативом
• Пријем и издавање лекова и медицинских средстава, припрему и реализацију поступака јавних набавки, као и информисање здравствених радника о правилној примени, употреби, чувању и одлагању лекова и медицинских средстава
• Израду и издавање магистралних лекова
• Унапређивање фармакотерапијских поступака, рационалну примену лекова и медицинских средстава, праћење потрошње и извештавање надлежних институција
• Пријављивање нежељених реакција на лекове и медицинска средства (фармаковигиланца и вигиланца медицинских средстава), као и повлачење из промета када је то потребно
• Управљање фармацеутским отпадом у складу са законском регулативом